MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 1502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	TTA	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001857	TAA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001857	TCT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_001857	ATA	2	6	82	87	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001857	ATTTTT	2	12	90	101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001857	AAAAAT	2	12	107	118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001857	TAC	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001857	T	8	8	138	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001857	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001857	TAA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001857	TA	3	6	187	192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001857	TAA	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001857	AAG	2	6	275	280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001857	AAAT	2	8	314	321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001857	TAT	2	6	390	395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001857	AATT	2	8	414	421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001857	TCT	2	6	476	481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_001857	TCT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_001857	TAT	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001857	GCAA	2	8	536	543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_001857	TTGC	2	8	566	573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_001857	ATTAAT	2	12	579	590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001857	TTA	2	6	591	596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001857	ATA	2	6	641	646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001857	A	7	7	655	661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001857	ATTAAT	2	12	669	680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001857	AC	3	6	716	721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_001857	A	8	8	772	779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001857	ATTT	2	8	803	810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001857	TGG	2	6	852	857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001857	ATTTA	2	10	873	882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001857	ATT	2	6	910	915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001857	AGCA	2	8	966	973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_001857	TTA	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001857	A	7	7	1045	1051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001857	A	7	7	1123	1129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001857	TTA	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001857	TAA	2	6	1140	1145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001857	ATA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001857	AATTAA	2	12	1168	1179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001857	CCT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_001857	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001857	ATT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001857	TAA	2	6	1355	1360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001857	TAA	3	9	1362	1370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001857	ATT	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001857	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001857	TAAT	2	8	1422	1429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001857	AAT	3	9	1427	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001857	A	7	7	1464	1470	100 %	0 %	0 %	0 %	11496894
51	NC_001857	ATT	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496894
52	NC_001857	ATG	2	6	1525	1530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
53	NC_001857	AAC	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496894
54	NC_001857	TGA	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
55	NC_001857	GAATT	2	10	1594	1603	40 %	40 %	20 %	0 %	11496894
56	NC_001857	AGCAA	2	10	1605	1614	60 %	0 %	20 %	20 %	11496894
57	NC_001857	TTAAAC	2	12	1641	1652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496894
58	NC_001857	TTA	2	6	1689	1694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496894
59	NC_001857	TAG	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
60	NC_001857	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
61	NC_001857	AGA	2	6	1799	1804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
62	NC_001857	A	6	6	1848	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	11496894
63	NC_001857	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
64	NC_001857	TAA	2	6	1946	1951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496894
65	NC_001857	TA	3	6	1964	1969	50 %	50 %	0 %	0 %	11496894
66	NC_001857	TAAT	2	8	1992	1999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001857	T	7	7	2040	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
68	NC_001857	TTAA	2	8	2049	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	11496895
69	NC_001857	TTTTA	2	10	2081	2090	20 %	80 %	0 %	0 %	11496895
70	NC_001857	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
71	NC_001857	T	7	7	2107	2113	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
72	NC_001857	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
73	NC_001857	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
74	NC_001857	T	6	6	2258	2263	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
75	NC_001857	TTA	2	6	2386	2391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
76	NC_001857	CT	4	8	2424	2431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
77	NC_001857	AGT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496895
78	NC_001857	TAT	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
79	NC_001857	GGCAT	2	10	2454	2463	20 %	20 %	40 %	20 %	11496895
80	NC_001857	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496895
81	NC_001857	CAAA	2	8	2548	2555	75 %	0 %	0 %	25 %	11496895
82	NC_001857	ATTT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	11496895
83	NC_001857	A	6	6	2728	2733	100 %	0 %	0 %	0 %	11496895
84	NC_001857	TAA	2	6	2797	2802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496895
85	NC_001857	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
86	NC_001857	TC	3	6	2819	2824	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
87	NC_001857	ATC	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496895
88	NC_001857	TCTA	2	8	2922	2929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_001857	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001857	AGA	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001857	A	7	7	2982	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001857	TA	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	11496896
93	NC_001857	T	6	6	3063	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
94	NC_001857	TTG	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
95	NC_001857	TAA	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
96	NC_001857	ACT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496896
97	NC_001857	TCT	2	6	3244	3249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
98	NC_001857	CAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496896
99	NC_001857	TCT	3	9	3361	3369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
100	NC_001857	GTA	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496896
101	NC_001857	T	6	6	3436	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
102	NC_001857	AAG	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
103	NC_001857	TTG	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
104	NC_001857	T	6	6	3488	3493	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
105	NC_001857	CAA	2	6	3500	3505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496896
106	NC_001857	ACC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496896
107	NC_001857	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
108	NC_001857	AGA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
109	NC_001857	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
110	NC_001857	AAT	2	6	3611	3616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
111	NC_001857	CAAT	2	8	3620	3627	50 %	25 %	0 %	25 %	11496896
112	NC_001857	AGA	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
113	NC_001857	T	6	6	3670	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
114	NC_001857	CTGTAT	2	12	3712	3723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496896
115	NC_001857	TCA	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496896
116	NC_001857	CCAC	2	8	3753	3760	25 %	0 %	0 %	75 %	11496896
117	NC_001857	TCT	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
118	NC_001857	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
119	NC_001857	CTT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
120	NC_001857	T	6	6	3994	3999	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
121	NC_001857	T	7	7	4041	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
122	NC_001857	T	8	8	4060	4067	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
123	NC_001857	T	7	7	4126	4132	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
124	NC_001857	TTA	2	6	4139	4144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496896
125	NC_001857	GTG	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496896
126	NC_001857	TCT	3	9	4180	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
127	NC_001857	AACA	2	8	4209	4216	75 %	0 %	0 %	25 %	11496896
128	NC_001857	TAA	3	9	4226	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
129	NC_001857	TAAAT	2	10	4256	4265	60 %	40 %	0 %	0 %	11496896
130	NC_001857	ATT	2	6	4278	4283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001857	TAAA	2	8	4288	4295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001857	TACA	2	8	4310	4317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_001857	ATGT	2	8	4322	4329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001857	TAA	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001857	T	7	7	4386	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001857	A	7	7	4397	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001857	TAAA	2	8	4419	4426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001857	TAA	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001857	A	6	6	4466	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001857	TAA	2	6	4476	4481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001857	ATT	2	6	4487	4492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001857	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001857	AAATTT	2	12	4550	4561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001857	A	7	7	4585	4591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001857	CTTAAG	2	12	4622	4633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_001857	TAAAAA	2	12	4653	4664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001857	CAT	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823347
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